Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms