Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH3O43739 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH3O43739 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms