Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR3O43731 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms