Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATCO43716 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATCO43716 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATCO43716 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATCO43716 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATCO43716 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms