Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN4O43707 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms