Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms