Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms