Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1E1O43324 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1E1O43324 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms