Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCP110O43303 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCP110O43303 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCP110O43303 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCP110O43303 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCP110O43303 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCP110O43303 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCP110O43303 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms