Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms