Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms