Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS1O15524 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms