Protein–RNA interactions for Protein: O15523

DDX3Y, ATP-dependent RNA helicase DDX3Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3YO15523 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX3YO15523 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX3YO15523 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms