Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNPATO15228 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPATO15228 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNPATO15228 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GNPATO15228 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GNPATO15228 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPATO15228 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GNPATO15228 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GNPATO15228 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPATO15228 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPATO15228 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPATO15228 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPATO15228 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GNPATO15228 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms