Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms