Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms