Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN9O14815 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms