Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CUX2O14529 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CUX2O14529 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CUX2O14529 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CUX2O14529 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUX2O14529 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUX2O14529 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CUX2O14529 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUX2O14529 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUX2O14529 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CUX2O14529 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CUX2O14529 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CUX2O14529 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CUX2O14529 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CUX2O14529 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CUX2O14529 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CUX2O14529 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CUX2O14529 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CUX2O14529 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CUX2O14529 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CUX2O14529 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CUX2O14529 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CUX2O14529 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CUX2O14529 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CUX2O14529 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CUX2O14529 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CUX2O14529 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CUX2O14529 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CUX2O14529 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CUX2O14529 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CUX2O14529 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CUX2O14529 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CUX2O14529 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CUX2O14529 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms