Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLIM4O00461 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms