Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms