Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DEV8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DEV8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
B4DEV8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
B4DEV8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
B4DEV8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B4DEV8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms