Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC85CA6NKD9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85CA6NKD9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms