Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37CA5D8V6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms