Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB19A4D1S5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB19A4D1S5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms