Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM30A4D0T7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms