Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms