Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F8A0AVK6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms