Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0D9SFI3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms