Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SAFB-208ENST00000590485 548 ntTSL 37.95□□□□□ -1.147e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DOCK8-208ENST00000469197 741 ntTSL 57.89□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 27.81□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-222ENST00000556768 1829 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KMT2C-210ENST00000489110 761 ntTSL 27.7□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-205ENST00000476976 657 ntTSL 37.59□□□□□ -1.197e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-209ENST00000578663 949 ntTSL 37.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-208ENST00000485027 1843 ntTSL 27.58□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD7-204ENST00000479456 2949 ntTSL 27.47□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 C5orf24-205ENST00000507390 269 ntTSL 27.32□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-212ENST00000508510 554 ntTSL 57.24□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-209ENST00000448277 829 ntTSL 57.16□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 HSDL2-205ENST00000488101 911 ntTSL 26.92□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-207ENST00000482287 727 ntTSL 36.81□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-203ENST00000546559 471 ntTSL 36.72□□□□□ -1.337e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RNF217-203ENST00000368415 592 ntTSL 46.69□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YIPF5-205ENST00000519064 684 ntTSL 26.68□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SRSF4-207ENST00000622143 614 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MACF1-221ENST00000487656 323 ntTSL 36.41□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-212ENST00000488032 263 ntTSL 46.26□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YIPF5-203ENST00000508754 793 ntTSL 26.24□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K5-205ENST00000554990 4812 ntTSL 26.23□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ARL8B-206ENST00000468010 452 ntTSL 56.14□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJB14-210ENST00000474664 960 ntTSL 25.96□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ARL8B-207ENST00000476343 207 ntTSL 35.92□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RNF217-205ENST00000432158 672 ntTSL 55.91□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-204ENST00000463622 1943 ntTSL 25.86□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SRSF4-203ENST00000477193 206 ntTSL 25.78□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF131-211ENST00000508795 465 ntTSL 55.71□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJB14-207ENST00000469942 6463 ntTSL 23.68□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DCTN2-213ENST00000549712 211 ntTSL 52.81□□□□□ -1.967e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TAF15-202ENST00000603346 702 ntTSL 29.77□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PPIB-202ENST00000558492 381 ntTSL 310.44□□□□□ -0.741e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GSTK1-204ENST00000442394 2219 ntTSL 512.25□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GSTK1-205ENST00000443571 850 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GSTK1-206ENST00000473649 2692 ntTSL 29.61□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 412.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 412.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 35.55□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-215ENST00000523922 493 ntTSL 323.94■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-210ENST00000520454 488 ntTSL 319.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-208ENST00000519916 597 ntTSL 210.6□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 YBX1-203ENST00000436427 1524 ntTSL 1 (best)23.06■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 SRM-203ENST00000465788 402 ntTSL 513.56□□□□□ -0.241e-9■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-215ENST00000601150 915 ntTSL 317.99■□□□□ 0.471e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 LDHB-210ENST00000544151 544 ntTSL 216.67■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-207ENST00000556831 729 ntTSL 215.02■□□□□ -01e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-212ENST00000597995 702 ntTSL 213.21□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 LDHB-204ENST00000450584 732 ntTSL 310.39□□□□□ -0.751e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-208ENST00000597172 577 ntTSL 210.13□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 MBNL1-214ENST00000466565 1096 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.051e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 LDHB-208ENST00000539782 487 ntTSL 37.62□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-203ENST00000554074 445 ntTSL 36.96□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 28.7
UTP3Q9NQZ2 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-9■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.94e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-208ENST00000474414 978 ntTSL 522.75■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-213ENST00000530753 571 ntTSL 418.59■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-214ENST00000530876 570 ntTSL 217.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-202ENST00000373520 1630 ntTSL 217.66■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-210ENST00000527163 567 ntTSL 515.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-211ENST00000527513 576 ntTSL 515.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-212ENST00000530485 482 ntTSL 513.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 IGFL2-AS1-201ENST00000594027 294 ntTSL 311.71□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 IGFL2-AS1-205ENST00000599817 340 ntTSL 211.58□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-205ENST00000570772 582 ntTSL 310.15□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 ESCO1-203ENST00000580101 575 ntTSL 411.87□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 P4HB-222ENST00000576380 943 ntTSL 321.5■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 28.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPUL1-210ENST00000595806 1659 ntTSL 222.01■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 28.5
UTP3Q9NQZ2 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)14.75□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 28.5
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-209ENST00000479693 1906 ntTSL 1 (best)28.99■■■□□ 2.236e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.216e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-205ENST00000467443 1869 ntTSL 219.05■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 28.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4052.8 ms