Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 38.28□□□□□ -1.082e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CEP85-208ENST00000491670 941 ntTSL 27□□□□□ -1.292e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 UBE2D2-206ENST00000510470 256 ntTSL 26.96□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PRC1-217ENST00000560423 755 ntTSL 36.38□□□□□ -1.394e-14■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 55.98□□□□□ -1.454e-14■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 NCKAP1-205ENST00000478449 713 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.642e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-206ENST00000427812 567 ntTSL 33.29□□□□□ -1.882e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 NCKAP1-203ENST00000471640 306 ntTSL 51.96□□□□□ -2.12e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TMEM56-204ENST00000463375 349 ntTSL 50.48□□□□□ -2.332e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TBC1D16-208ENST00000574427 683 ntTSL 219.32■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TBC1D16-206ENST00000573782 685 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TBC1D16-207ENST00000574241 770 ntTSL 314.68□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HP1BP3-207ENST00000419948 759 ntTSL 54.35□□□□□ -1.714e-37■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-216ENST00000591267 460 ntTSL 520.43■□□□□ 0.862e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-207ENST00000588390 556 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.532e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 414.02□□□□□ -0.172e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 AC012313.3-203ENST00000596636 436 ntTSL 513.88□□□□□ -0.192e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 WWP1-203ENST00000518683 2002 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.32e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-203ENST00000585650 520 ntTSL 55.86□□□□□ -1.472e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC13A5-204ENST00000570687 419 ntTSL 33.11□□□□□ -1.911e-15■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.032e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CNOT11-203ENST00000462489 572 ntTSL 22.34□□□□□ -2.032e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC6A6-201ENST00000452151 284 ntTSL 56.32□□□□□ -1.41e-9■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SDCCAG3-211ENST00000486441 570 ntTSL 513.1□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC39A14-205ENST00000517370 839 ntTSL 312.87□□□□□ -0.352e-22■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-18■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-18■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 NEU4-216ENST00000494678 491 ntTSL 418.77■□□□□ 0.63e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CFB-278ENST00000472581 1059 ntTSL 215.13■□□□□ 0.013e-21■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CFB-279ENST00000475617 586 ntTSL 47.5□□□□□ -1.213e-21■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.413e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.833e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FASTKD1-206ENST00000487293 681 ntTSL 22.13□□□□□ -2.073e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.831e-11■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-202ENST00000562362 713 ntTSL 320.87■□□□□ 0.933e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAP3K11-213ENST00000534432 664 ntTSL 317.92■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 DDX27-202ENST00000462328 824 ntTSL 515.87■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-203ENST00000563490 718 ntTSL 214.59□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-204ENST00000567511 696 ntTSL 513.21□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 312.83□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 PCSK6-204ENST00000558154 852 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-205ENST00000568572 446 ntTSL 510.72□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ATP5G1-205ENST00000504591 401 ntTSL 210.05□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAT1A-202ENST00000455001 435 ntTSL 510.01□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAP3K11-205ENST00000526647 582 ntTSL 37.94□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 35.83□□□□□ -1.483e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 NGDN-206ENST00000556022 999 ntTSL 25.55□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 35.53□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 NGDN-210ENST00000556580 629 ntTSL 25.46□□□□□ -1.543e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FXR1-217ENST00000484042 562 ntTSL 44.31□□□□□ -1.723e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 226.77■■□□□ 1.885e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 SOD2-212ENST00000540491 454 ntTSL 317.94■□□□□ 0.465e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 L3MBTL1-209ENST00000439769 460 ntTSL 416.97■□□□□ 0.315e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ASMTL-AS1-204ENST00000443929 574 ntTSL 215.59■□□□□ 0.095e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ARHGEF17-203ENST00000536481 697 ntTSL 213.52□□□□□ -0.255e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 RALGAPA2-206ENST00000620717 1432 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 210.69□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-206ENST00000450085 580 ntTSL 49.71□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 CERK-204ENST00000471929 567 ntTSL 49.65□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 58.99□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 48.18□□□□□ -1.15e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-210ENST00000506698 619 ntTSL 48.13□□□□□ -1.115e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 TCEA3-205ENST00000476978 855 ntTSL 36.69□□□□□ -1.345e-13■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-207ENST00000465690 584 ntTSL 44.66□□□□□ -1.665e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-205ENST00000427334 570 ntTSL 43.94□□□□□ -1.785e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 52.27□□□□□ -2.055e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 SSX2IP-202ENST00000422026 759 ntTSL 314.44□□□□□ -0.14e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 SRPK1-207ENST00000505885 566 ntTSL 22.89□□□□□ -1.954e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 EIF4G2-227ENST00000533485 806 ntTSL 27.11□□□□□ -1.275e-9■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 EZH1-204ENST00000585550 1643 ntTSL 1 (best)9.56□□□□□ -0.882e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.32e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ZNF638-218ENST00000486494 973 ntTSL 25.21□□□□□ -1.582e-15■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 STRN3-204ENST00000554124 785 ntTSL 43.2□□□□□ -1.92e-12■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MIER1-210ENST00000479067 745 ntTSL 54.05□□□□□ -1.763e-7■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FANCA-222ENST00000567205 413 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FAM219B-210ENST00000564723 208 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-204ENST00000558934 1422 ntTSL 57.56□□□□□ -1.22e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-206ENST00000559527 899 ntTSL 55.97□□□□□ -1.452e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-205ENST00000559293 419 ntTSL 33.26□□□□□ -1.892e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TFRC-213ENST00000482479 540 ntTSL 33.61□□□□□ -1.832e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 217.45■□□□□ 0.385e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 DBN1-205ENST00000471767 428 ntTSL 516.94■□□□□ 0.35e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.275e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.175e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-8■□□□□ 8.4
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