Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQE9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQE9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQE9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQE9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQE9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQE9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQE9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQE9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQE9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQE9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms