Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN6Q9Y6Q1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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