Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARFGEF1Q9Y6D6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms