Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX8Q9Y5X2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms