Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP16Q9Y5T5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms