Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms