Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB2Q9Y5E7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB2Q9Y5E7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms