Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAF6Q9Y4K3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF6Q9Y4K3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms