Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP3Q9Y446 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms