Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHDC2Q9Y2U9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms