Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC12A4Q9UP95 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms