Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABT1Q9ULW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABT1Q9ULW3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms