Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA3Q9UL41 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA3Q9UL41 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms