Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms