Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms