Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms