Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PARP4Q9UKK3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms