Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP21Q9UK80 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms