Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX4Q9UIU6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms