Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS51Q9UID3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms